奧林巴斯激光共集焦掃描顯微鏡有以下顯著的優點：
①：高分辨率觀察顯微鏡——OLS3100達到了激光共聚焦系列的頂級分辨率0.12um。
②：高精度的表面輪廓測量儀——使用了現代化的機器人技術提高了Z軸垂直度，摒棄了原始的調焦方式樣品放置在載物臺上，通過載物臺的上下移動而進行聚焦，讓調焦通過物鏡轉盤的上下移動而進行聚焦，保證了樣品放置位置在載物臺上不會因為聚焦而發生變化，也保證了聚焦拍照成像的過程中物鏡和樣品縱向焦點位置在同一條縱軸上，從而達到高精度的表面輪廓掃描測量。
③：三維形貌顯微鏡——在激光照明時采用傳輸速度最快，實時性最好的PMT（光電倍增管）做采集介質，從而能快速的三維成像。
